總處設下列處、室：
一、綜合規劃處，分四科辦事。
二、公務預算處，分八科辦事。
三、基金預算處，分五科辦事。
四、會計決算處，分四科辦事。
五、綜合統計處，分八科辦事。
六、國勢普查處，分七科辦事。
七、主計資訊處，分五科辦事。
八、秘書室，分三科辦事。
九、人事處，分四科辦事。
十、政風室。
十一、主計室。

配合主計機構人員設置管理條例第六條規定，將會計室修正為主計室。