2011.
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(訂定)
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申請外籍郵輪來臺靠泊非國際商港作業程序 (107.11.06)
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2012.
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(訂定)
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貨櫃集散站入侵紅火蟻監測與防治及管制標準作業程序 (110.07.20)
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2013.
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(訂定)
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臺東交通客船乘客與運送人運送糾紛調處程序 (089.02.09)
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2014.
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(訂定)
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交通部基隆港務局處理香港、澳門籍船舶進出港懸旗作業程序 (097.05.26)
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2015.
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(修正)
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臺灣港務股份有限公司基隆港務分公司轄屬港區船舶在港小修及港區燒焊
申請作業程序 (104.02.11)
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2016.
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(修正)
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臺灣港務股份有限公司基隆港務分公司轄屬港區船舶碰撞港埠設施處理作
業程序 (104.02.26)
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2017.
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(訂定)
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臺中港船舶緊急進港作業處理程序 (099.04.21)
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2018.
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(修正)
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中華民國籍商船遭海盜攻擊或武裝劫掠標準作業程序 (102.11.01)
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2019.
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(修正)
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交通部航港局高速船申請航行許可證書試航作業程序 (110.06.17)
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2020.
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(停止適用)
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民用航空運輸業固定翼航空器飛航作業管理程序 (089.11.30)
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2021.
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(停止適用)
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適航證書請領程序 (092.04.16)
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2022.
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(停止適用)
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民用航空器維護簽證程序 (092.08.27)
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2023.
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(停止適用)
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民用航空器計畫維護程序 (092.02.27)
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2024.
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(訂定)
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國籍航空公司申請飛航「大陸臺商春節返鄉專案」間接包機作業程序 (091.12.04)
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2025.
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(訂定)
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國籍航空公司因應美伊戰爭期間申請飛越大陸空域作業程序 (092.03.21)
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2026.
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(訂定)
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國籍航空公司申請飛航大陸間接貨運包機作業程序 (092.09.19)
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2027.
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(修正)
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民用航空局飛航測試程序 (092.09.02)
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2028.
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(訂定)
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國籍航空公司申請飛航「大陸臺商春節返鄉專案」包機作業程序 (094.01.18)
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2029.
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(訂定)
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大陸籍航空公司申請飛航「大陸臺商春節返鄉專案」包機作業程序 (094.01.18)
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2030.
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(訂定)
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國籍航空公司申請飛越大陸空域作業程序 (094.08.15)
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2031.
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(訂定)
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國籍航空公司申請飛航兩岸春節客運包機作業程序 (094.12.01)
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2032.
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(訂定)
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大陸籍航空公司申請飛航兩岸春節客運包機作業程序 (094.12.01)
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2033.
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(修正)
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大陸籍航空公司申請飛航兩岸「緊急醫療包機」及「特定人道包機」作業程序 (097.08.15)
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2034.
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(修正)
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大陸籍航空公司申請飛航兩岸節日客運包機作業程序 (097.08.15)
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2035.
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(訂定)
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超輕型載具活動空域申請程序 (097.04.02)
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2036.
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(訂定)
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國籍航空公司申請飛航兩岸週末客運包機作業程序 (097.06.20)
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2037.
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(訂定)
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大陸籍航空公司申請飛航兩岸週末客運包機作業程序 (097.06.20)
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2038.
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(訂定)
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國籍航空公司申請飛航兩岸客運包機作業程序 (097.12.12)
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2039.
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(訂定)
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大陸籍航空公司申請飛航兩岸客運包機作業程序 (097.12.12)
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2040.
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(訂定)
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國籍航空公司申請飛航兩岸貨運包機作業程序 (097.12.12)
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