審查三科掌理貨物稅、菸酒稅、證券交易稅、期貨交易稅之調查、稽徵
  ，違章檢舉之查緝及專案調查等事宜。分設四股，各股之職掌如下：
  一、貨物稅菸酒稅股：
    （一）蒐集經銷商名冊、報章雜誌或廣告等課稅資料。
    （二）以行業代號列印產製應稅貨物及菸酒之營業人名冊。
    （三）各單位通報資料研析運用或核轉。
    （四）外轄廠商違章案件之通報。
    （五）加強貨物稅菸酒稅稽徵及防止逃漏查緝工作計畫之訂定與執行
          。
    （六）貨物稅菸酒稅選案查核計畫之訂定與執行。
    （七）貨物稅飲料品抽樣化驗作業計畫之訂定與執行。
    （八）專案查核之規劃與執行。
    （九）貨物稅廠商申請或停止實施以出（送）貨單或出廠證替代完稅
          照案件核轉。
    （十）貨物稅廠商電子計算機開立專用完（免）稅照申請案之核准或
          核轉。
    （十一）貨物稅廠商申請以倉庫移運單（或其他）替代臨時運單之核
            轉。
    （十二）貨物稅菸酒稅法令疑義、稽徵作業之請釋、宣導及解答（含
            研提意見）。
    （十三）貨物稅菸酒稅各項月報及統計報表之編造、彙報。
    （十四）貨物稅菸酒稅相關業務規劃、督導及其他行政業務之處理。
  二、證券交易稅期貨交易稅股：
    （一）證券商代徵證券交易稅及期貨商代徵期貨交易稅業務之查核。
    （二）上市公司股票讓售資料之調查及處理。
    （三）代徵獎金之核發。
    （四）更正退稅案件之審查。
    （五）違章案件之審查。
    （六）法令疑義之請釋及解答。
    （七）證券商、期貨商及未上市公司訪查計畫之訂定與執行。
    （八）公文收發及催辦。
    （九）其他行政事項之處理。
  三、查緝一股、二股：
    （一）年度查緝作業計畫之訂定及執行。
    （二）檢舉密告案件之查緝及會審。
    （三）有關單位通報違章案件之審查。
    （四）違漏案件顯涉刑事責任且需擴大追查者。
    （五）主動蒐集違漏資料追查案件。
    （六）違章查緝案件之分案、派查。
    （七）派查案件之稽催及管制。
    （八）其他機關委查事項之處理。
    （九）上級交辦事項之處理。