機動巡查隊查掌理進、出口貨物之抽、複查及巡邏事宜。分設四分隊，
  各分隊之職掌如左：
  一、進、出口貨物、轉運貨物及進、出口郵包之抽驗、複驗。
  二、入、出境旅客及機員行李之複查。
  三、保稅倉庫、免稅商店、私貨倉庫及逾期貨倉庫貨物之抽查。
  四、海關監管保稅工廠業務之查核。
  五、密報案件之查緝。
  六、其他交辦事項。