本局局長綜理局務，副局長襄理局務，其業務如左：
一、有關農產品、畜水產品檢驗事項。
二、有關工礦產品檢驗事項。
三、有關檢驗行政及法規事項。
四、有關檢（試）驗業務執行事項。
五、有關動植物檢疫事項。
六、有關文書、總務、議事及公共關係事項。
七、有關人事管理事項。
八、有關歲計、會計、統計事項。