第二課課長承分局長之命綜理課務並督率所屬分辦左列事項。
  一、關於冷凍食品（包括肉品、水產品、蔬果）工廠品管及工廠分等檢
      驗登記申請調查事項。
  二、關於冷凍食品分等檢驗工廠品質管制之追查產品抽驗及技術輔導事
      項。
  三、關於冷凍食品檢驗之執行事項。
  四、關於畜水產品及冷凍食品出口驗對執行事項。
  五、關於畜水產品及冷凍食品委託試驗之執行事項。
  六、關於畜水產品及冷凍食品委託試驗有關紀錄之填報與評定事項。
  七、關於合格標識監貼與註銷事項。
  八、關於動物及畜水產品之檢驗（疫）冷凍食品檢驗標準及方法之研究
      改進建議事項。
  九、關於檢驗（疫）及試驗研究等儀器藥品用具之籌劃、添置、領用與
      維護管理事項。
  十、關於動物進出口檢疫之執行事項。
  十一、關於畜產品（包括鬃毛絨羽類）檢驗（疫）及消毒燻蒸事項。
  十二、關於進出口染疫動物之撲殺焚化等處理事項。
  十三、關於動物及畜產品進出口運送工具包裝材料等之消毒燻蒸事項。
  十四、關於動物隔離檢疫中心設施管理事項。
  十五、關於動物畜水產品及冷凍食品等產地生產狀況調查事項。
  十六、關於動物檢疫畜水產品檢驗（疫）及冷凍食品檢驗數量之統計事
        項。
  十七、關於本課員工工作分配督導考核事項。
  十八、關於本課主管工作報告法規公文之撰擬收發登記事項。
  十九、其他臨時交辦事項。