業務課掌理下列事項：
  一、商港設施經營管理事項。
  二、商港營運發展企劃事項。
  三、船舶貨物裝卸承攬業、拖駁船業經營許可事項。
  四、港埠業務費計收事項。
  五、商港服務費收取事項。
  六、旅客服務事項。
  七、客戶服務事項。
  八、勞工安全衛生管理、訓練宣導及職業災害處理事項。
  九、辦理港埠作業委託事項。
  十、專戶經理人之聯繫事項。
  十一、其他交辦事項。