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1.
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(廢止)
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獎勵國人上漁船工作輔導計畫（第一期） (109.06.19)
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2.
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(修正)
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農業部主管漁港基本設施使用管理費收費類目及費率 (113.01.29)
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3.
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(停止適用)
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加速農村建設「輔導養殖漁戶生產貸款要點」 (094.12.30)
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4.
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(廢止)
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我國九十四年赴大西洋從事捕撈鮪旗魚類作業中非屬長鰭鮪組漁船作業規
定 (102.10.28)
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5.
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(修正)
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行政院農業委員會漁業署監督所補助或受委辦法人及團體辦理採購作業要
點 (097.10.27)
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6.
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(廢止)
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漁船違反作業時限或延長作業規定逾期返港、漁船出海作業未依規定配置各級船員及船長或輪機長無故離船之處分 (111.03.29)
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7.
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(停止適用)
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行政院農業委員會漁業署主管機密項目 (112.10.12)
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8.
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(廢止)
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一百零一年度漁船赴大西洋從事捕撈鮪類及類鮪類作業應行遵守及注意事
項 (106.06.16)
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9.
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(修正)
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臺灣地區漁船船主境外僱用大陸地區漁船船員搭乘直航客船及接駁管理措
施 (106.12.06)
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10.
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(訂定)
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亞東關係協會與公益財團法人交流協會漁業協議 (102.07.19)
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11.
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(修正)
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養殖魚類臺灣良好農業規範（TGAP） (107.10.17)
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12.
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(修正)
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蝦仁初級處理臺灣良好農業規範（TGAP） (105.04.14)
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13.
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(訂定)
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牡蠣初級處理臺灣良好農業規範（TGAP） (105.08.19)
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14.
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(訂定)
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貝類臺灣良好農業規範（TGAP） (105.08.19)
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15.
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(修正)
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遠洋漁業條例第十三條第一項第十一款禁捕魚種名錄 (110.01.11)
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16.
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(訂定)
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甲魚（鱉）初級處理臺灣良好農業規範（TGAP） (106.03.22)
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17.
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(訂定)
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甲魚（鱉）臺灣良好農業規範（TGAP） (106.03.22)
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18.
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(修正)
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拖網漁船禁漁區位置及有關限制事宜 (110.05.03)
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19.
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(廢止)
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台灣省漁會年度考核計分標準及計分表 (106.06.14)
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20.
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(廢止)
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區漁會年度考核計分標準及計分表 (106.06.15)
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21.
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(廢止)
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第一類漁港設攤為應經核准之行為 (113.03.12)
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22.
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(訂定)
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溯源水產品溯源資訊項目及標示方式 (109.12.28)
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23.
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(訂定)
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產銷履歷養殖水產品驗證費用補助方式 (110.11.29)
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24.
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(廢止)
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高雄市一百噸以上漁船申報進出港流程及申請書格式 (112.08.22)
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25.
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(修正)
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漁業法 (107.12.26)
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26.
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(修正)
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漁港法 (095.01.27) 
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27.
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(修正)
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投資經營非我國籍漁船管理條例 (105.07.20)
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28.
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(訂定)
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遠洋漁業條例 (105.07.20)
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29.
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(廢止)
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行政院農業委員會漁業署漁業廣播電臺組織規程 (112.11.29)
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30.
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(修正)
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漁業權登記規則 (095.12.01)
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