會計室掌理歲計、會計（含徵課）及統計等事宜。分設四股，各股之職
  掌
  一、第一股：
    （一）歲出概（預）算之籌劃、審核及彙編與預算追加、追減及變更
          之辦理。
    （二）分配預算之審核、彙編及修正分配預算之辦理、審核。
    （三）經費流用、保留之辦理、審核。
    （四）本局之預算之控制。
    （五）動支第一、二預備金之申請。
    （六）內部審核業務之執行。
    （七）營繕工程及購置、定製之監辦。
    （八）績效報告之審核、彙編。
    （九）主計法規之研究、建議及改進。
    （十）其他上級交辦事項。
  二、第二股：
    （一）經費類記帳憑證之編製與會計簿籍之登載、清理與核結。
    （二）國庫集中支付書表之編報及審查。
    （三）經費類會計憑證、簿籍及會計案卷之整理、保管及送審。
    （四）內部事後複核業務之執行。
    （五）各種代收款項收付之審核。
    （六）本局及各稽徵所零用金之分配、審核、撥補及檢查。
    （七）本局採購事項之監驗。
    （八）經費類會計報告之審核、彙編。
    （九）各分局經費類會計事務之督導、檢查及考核。
    （十）歲出決算之審核、彙編。
    （十一）其他上級交辦事項。
  三、第三股：
    （一）徵課會計報告及各項報表之審核、彙編。
    （二）歲入類會計憑證、報表之編製、審核、登帳及裝訂、保管。
    （三）歲入類會計報告之審核、彙編。
    （四）歲入預算之分配及歲入決算之審核、彙編。
    （五）歲入會計及徵課會計業務之內部審核及管理。
    （六）各項違章案件財務罰鍰之彙編、核對及獎金提成分配之審核。
    （七）彙編國稅收入簡報。
    （八）編製各項國稅之預算執行及稅收徵績。
    （九）其他上級交辦事項。
  四、第四股：
    （一）國稅徵課實況統計報表之編報。
    （二）公務統計報表之編報。
    （三）國稅收入之調查、統計及分析。
    （四）年度統計資料之核編、發布及提供。
    （五）統計書刊及資料之建檔與管理。
    （六）本局及所屬主計人員之任免、遷調、送審、獎懲、考核等人事
          作業及「主計人事資訊系統」之管理。
    （七）公文之收發、催辦及管理。
    （八）其他行政綜合業務及上級交辦事項。