資訊室掌理資料處理事項。分設三股，各股之職掌如左：
  一、第一股：
    （一）電腦機房、硬體設備及相關通訊網路之管理及維護。
    （二）協助電腦及相關設備驗收事項。
    （三）資訊作業有關年度概算之編製。
    （四）套裝軟體之管理。
  二、第二股：
    （一）進口、出口、轉運轉口通關作業系統之推動與輔導。
    （二）海運貨物通關自動化連線報關磁卡之製作。
  三、第三股：
    （一）公文收發等總務工作。
    （二）交易代碼安全控管。
    （三）「不屬於准許間接進口大陸產原料錄案」資料登錄。
    （四）進口、出口、轉運轉口通關作業系外系統之推動與輔導。