經濟及公共建設處分設四科，各科掌理事項如下：
  一、原住民金融科：
    （一）原住民族綜合發展基金之管理及輔導事項。
    （二）原住民金融業之規劃、協調及輔導事項。
    （三）原住民族綜合發展基金經濟事業貸款與信用保證業務處理之規
          劃、協調、輔導及審定事項。
    （四）原住民工商企業、服務業、合作互助事業及信託之規劃、協調
          及輔導事項。
    （五）原住民族之土地各項收益款使用審議及輔導事項。
    （六）其他有關原住民族金融事項。
  二、產業發展科：
    （一）原住民農、林、漁、牧、獵業務與觀光事業之規劃、協調及輔
          導事項。
    （二）原住民傳統技藝、智慧財產權與文化產業之規劃、協調及輔導
          事項。
    （三）原住民產業經營與技藝研習、培訓之規劃、推動及輔導事項。
    （四）原住民民宿事業之規劃、協調及輔導事項。
    （五）原住民地區生態旅遊之規劃、協調及輔導事項。
    （六）其他有關原住民產業發展事項。
  三、住宅輔導科：
    （一）原住民住宅改善之規劃、協調、輔導及審議事項。
    （二）原住民族住宅貸款之規劃、協調、輔導及審議事項。
    （三）原住民遷居都會區安置住所之規劃、協調及輔導事項。
    （四）原住民部落建築之規劃、協調及輔導事項。
    （五）其他有關原住民住宅輔導事項。
  四、部落建設科：
    （一）原住民部落與社區生活環境設施改善之規劃、協調、輔導及審
          議事項。
    （二）原住民地區部落安全防治與遷建之規劃、協調及輔導事項。
    （三）原住民地區交通水利、飲水設施改善之規劃、協調及輔導事項
          。
    （四）原住民地區公共設施災後復建審議之配合事項。
    （五）原住民地區整建原住民部落新風貌之規劃、協調及輔導事項。
    （六）其他有關原住民部落建設事項。