本署設下列組、室: 一、庫務管理組,分四科辦事。 二、支付管理組,分四科辦事。 三、債務管理組,分三科辦事。 四、財務規劃組,分三科辦事。 五、公股管理組,分四科辦事。 六、菸酒管理組,分四科辦事。 七、秘書室,分三科辦事。 八、人事室。 九、政風室。 十、主計室。 十一、資訊室,分二科辦事。