本局設下列各科、中心、廠、場、室，分別掌理下列事項：
一、綜合規劃科：綜合規劃、環境資訊、環境影響評估、環境政策效益評
    估、環境統計、環境期刊發行及文書、環境教育宣導及環保志工培訓
    等事項。
二、空氣品質維護科：空氣污染防制、噪音與振動管制、氣懸膠與空氣品
    質研究、交通工具污染控制研究及噪音及振動之管理研究等事項。
三、水質保護科：水污染防治、飲用水管理、土壤與地下水污染整治、土
    壤污染防治與復育研究、溼地與礫間生態及污水處理研究、河川與地
    下水污染防治研究、水庫水質研究及海洋污染防治等事項。
四、環境衛生管理科：全市環境衛生、資源回收、家戶垃圾之整體政策規
    劃與督導、乾淨城市架構推展策略及文宣設計與活動辦理、辦理清潔
    隊業務督導、綜合業務、一般廢棄物垃圾清理費徵收政策規劃等事項
    。
五、循環資源科：巨大廢棄物修繕中心管理運作、環保小舖及幸福小站推
    動、源頭減量推動、強制分類、限用政策、家戶垃圾收集及清運路線
    調整、垃圾清運路線查核、垃圾轉運站、資源回收廠及廚餘處理站管
    理、家戶水肥清運等事項。
六、清潔維護科：道路及海岸清潔維護及巡查、病媒孳生源清除及消毒、
    髒亂點清除維護、天然災害緊急應變清理、廣告物管理及停話作業、
    廢棄車輛查報及移置、公廁督導管理、檢舉達人案件處理、綠色生活
    網經營管理等事項。
七、環境庶務科：清潔隊勞動契約及工作規則訂定、清潔車輛、用具及物
    品汰換與管理、清潔隊職業安全衛生及職業災害、勞資爭議協調、勤
    惰管理及安全衛生訓練、清潔隊糾紛處理及肇事處理等事項。
八、事業廢棄物管理科：事業廢棄物管理、環境用藥管理及毒性化學物質
    管理等事項。
九、環境檢驗科：空氣污染、水污染、廢棄物、飲用水、環境品質監測數
    據管理統計應用分析及其他環境檢驗分析等事項。
十、廢棄物處理規劃科：廢棄物處理廠（場）規劃設置、營運督導、廢清
    基金管理運作、舊垃圾掩埋場監督管理、資源回收再生能源廠（場）
    設置、固體廢棄物處理策略、焚化廠存廢研議、回收再利用研究、垃
    圾清運區域最佳化研究、垃圾性質長期掌握與分析及垃圾掩埋場活化
    研究等事項。
十一、環保稽查科：執行違反環境保護法規案件之稽查、告發、裁決、催
      繳、移送強制執行及行政救濟等事項。
十二、低碳社區發展中心：省電節能、綠色交通、資源再利用、低碳生活
      、低碳產業等五大面向之規劃及推廣、國際資訊彙整與利用、二氧
      化碳捕集、利用與封存研究、催化燃燒與節能減排研究、低碳技術
      開發、低碳城市規劃、低碳經濟理論與政策研究、綠色能源技術、
      零碳建成環境、太陽能光電技術、氫能源研發、海洋能源研究及生
      質能源研究等事項。
十三、新店垃圾焚化廠：區域性垃圾處理業務、廢棄物焚化廠運轉、操作
      之監督及管理等事項。
十四、樹林垃圾焚化廠：區域性垃圾處理業務、廢棄物焚化廠、飛灰固化
      處理廠運轉、操作之監督及管理等事項。
十五、八里垃圾焚化廠：區域性垃圾處理業務、廢棄物焚化廠運轉、操作
      之監督及管理等事項。
十六、八里垃圾掩埋場：區域性垃圾處理業務、廢棄物掩埋及飛灰處理之
      操作、維護、管理等事項。
十七、秘書室：文書、檔案管理、公文管理、事務、出納、採購、財產管
      理、法制、公害糾紛處理、研考、資訊管理、公共關係、新聞發布
      ，綜合業務及不屬其他各科、中心、廠、場、室之事項。

除烏來區外，本局得於其餘各區設清潔隊，辦理各轄區環境衛生垃圾清運
、資源回收工作及特區重大環境維護專案執行、各轉運站或資收廠（場）
現場操作、巡查及舉發等環境衛生案件處理、綠色生活網實際操作維護等
事項。
清潔隊置隊長、分隊長，各隊配屬員額由本局總員額內分配。

本局設會計室，置主任、專員、股長、科員、佐理員，依法辦理歲計、會
計及統計事項。

本局設人事室，置主任、專員、股長、科員、助理員，依法辦理人事管理
事項。

本局設政風室，置主任、專員、股長、科員，依法辦理政風事項。