本局設下列科、室，分別掌理各有關事項：
一、運輸規劃科：交通政策擬定與推動、運輸系統整合規劃、基地開發交
    通影響評估審查、區域道路交通改善及道路新闢規劃、督導道路交通
    安全業務規劃及執行、道安會報相關業務、重要交通工程施工期間交
    通維持計畫之審議督導及交通裁罰等事項。
二、交通工程科：標誌、標線、號誌、安全設施之規劃設計及交通管制工
    程設施管理維護等事項。
三、停車管理工程科：停車管理策略之研擬、公有路外停車場設施之規劃
    、設計、興建、管理、與督導改善事項、路邊停車格規劃、設置、維
    護與管理、停車裁罰事項及停車場作業基金之管理與運用等事項。
四、軌道建設科：軌道運輸之路廊規劃與建設、工程介面行政整合、工程
    與預算執行管理、軌道建設發展基金管理與運用、場站開發及大眾捷
    運營運管理等事項。
五、公共運輸科：本縣大眾運輸（汽車運輸業、長途客運等）營運管理、
    運價審議、公共運輸場站與等候設施建置工程及計程車業務管理等事
    項。
六、秘書室：文書、檔案、出納、總務、財產管理與資訊、法制、公關、
    研考業務及不屬於其他各單位事項。