港區衛生管理組職掌如左：
  一、關於港區、航空站、航空器、船舶、貨櫃、貨物、倉庫等減鼠、滅
      蟲及蒸燻消毒業務之規劃事項。
  二、關於港區、航空站、航空器、船舶等飲水、食品、器具之衛生管理
      規劃事項。
  三、關於港區、航空站病媒調查及管制事項。
  四、關於檢疫之檢驗事項。
  五、關於各檢疫分所港區衛生管理業務之規劃、推展、督導及管理事項
      。
  六、關於蒸燻、病媒、檢驗人員之訓練事項。
  七、關於蒸燻、衛生、檢驗業務藥品器材之籌劃事項。
  八、關於蒸燻、衛生、檢驗業務資料之建立、編報、統計事項。
  九、關於上級交辦事項。