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91.
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(修正)
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海域環境分類及海洋環境品質標準 (113.04.25)
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92.
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(停止適用)
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臺灣地區沿海水區範圍、水體分類及水質標準 (089.08.30)
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93.
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(訂定)
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土壤污染監測標準 (100.01.31)
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94.
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(廢止)
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水體水質監測站設置及監測準則（84.08.23訂定） (104.12.18)
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95.
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(廢止)
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違反水污染防治法按日連續處罰執行準則 (104.08.24)
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96.
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(修正)
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飲用水水質處理藥劑申請公告作業準則 (103.08.15)
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97.
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(修正)
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違反水污染防治法罰鍰額度裁罰準則 (113.11.07)
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98.
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(修正)
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辦理土壤及地下水污染場址整治目標公聽會作業準則 (105.01.22)
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99.
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(修正)
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污染土地關係人之善良管理人注意義務認定準則 (102.11.11)
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100.
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(訂定)
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違反水污染防治法按次處罰通知限期改善或補正執行準則 (104.08.24)
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101.
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(訂定)
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水體水質監測站設置及監測準則（104.12.16訂定） (104.12.16)
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102.
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(廢止)
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環境檢驗測定機構違反水污染防治法裁罰準則 (108.10.05)
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103.
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(訂定)
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廢（污）水處理專責人員違反水污染防治法罰鍰額度裁罰準則 (105.05.19)
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104.
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(訂定)
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農業用地污染改善與太陽光電設施設置併行計畫補助要點 (108.06.14)
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105.
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(修正)
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公有土地放領影響水源涵養國土保安及自然保育認定作業要點 (091.11.01)
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106.
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(廢止)
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環境工程技師執行水污染簽證業務查核要點 (110.12.24)
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107.
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(停止適用)
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土壤及地下水污染整治法公布施行後過渡時期執行要點 (093.12.31)
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108.
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(訂定)
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加強公共工程空氣污染及噪音防制管理要點 (107.05.17)
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109.
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(訂定)
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廢（污）水以海洋放流管線排放於海洋之放流水污染物削減管理計畫審核
作業要點 (107.02.26)
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110.
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(停止適用)
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預鑄式建築物污水處理設施審核作業要點 (109.01.06)
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111.
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(停止適用)
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事業及污水下水道系統廢（污）水處理設施操作及放流水水質水量電子郵件申報作業要點 (098.06.03)
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112.
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(停止適用)
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廢棄物清理法修正公布施行後過渡時期執行要點 (108.10.22)
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113.
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(停止適用)
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土壤及地下水污染整治個案監督作業要點 (098.01.23)
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114.
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(廢止)
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土壤及地下水污染控制場址進行污染改善推動執行要點 (109.02.06)
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115.
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(修正)
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受委託機關辦理水污染防治措施計畫審核作業查核管理要點 (104.08.10)
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116.
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(停止適用)
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水污染事件緊急應變聯防體系作業要點 (097.06.18)
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117.
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(訂定)
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水污染事件緊急應變及聯防體系作業要點 (097.06.18)
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118.
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(廢止)
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土壤及地下水污染整治法修正公布施行後過渡時期執行要點 (109.02.06)
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119.
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(訂定)
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放流水生物急毒性削減管理計畫審核作業要點 (100.01.25)
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120.
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(修正)
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土壤及地下水污染整治法相關法規及環境教育講習執行要點 (113.11.04)
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