本處設左列各組室，分別掌理各有關事項並得分課辦事：
  一、營銷組：掌理系統營運費率、現金處理、票證、廣告、販賣店之規
      劃與管理、財務、保安規劃、公司籌組、研考及其他綜合性事項。
  二、運務組：掌理系統運務規章、手冊、作業程序及管理制度之研擬，
      運務人員調派作業、旅客及系統安全防護之籌劃及運務人員之儲備
      等事項。
  三、維修組：掌理系統維修計畫、規章、手冊作業程序、自辦或外包維
      修項目及管理制度之研擬、維修人員調派作業、物料及資訊管理之
      規劃，以及維修人員之儲備等事項。
  四、編訓組：掌理系統營運與維修訓練規劃、訓練需求分析、師資培養
      、訓練設備規劃、人員儲訓等事項。
  五、聯合開發組：掌理聯合開發計畫投資、興建及管理執行計畫之研訂
      、聯合開發計畫之招標、財務規劃及經營管理規章制度之訂定等事
      項。
  六、財務室：掌理財務計畫之研擬、財務分析、財產管理及財務調度等
      事項。
  七、行政室：掌理法制、公關、議事、文書、印信、出納、事務管理及
      不屬其他組室事項。