底泥之分類管理如下：
  一、底泥品質指標項目濃度高於上限值者，應依下列規定辦理：
    （一）目的事業主管機關應針對該項目增加檢測頻率，並通知農業、
          衛生主管機關依權責檢測生物體及已上市水產品內污染物質。
    （二）農業、衛生主管機關於辦理前目工作後發現濃度偏高時，得本
          於權責就水體內生物體及已上市水產品依法進行相關管制與監
          督管理事項，並通知直轄市、縣（市）主管機關。
    （三）直轄市、縣（市）主管機關於接獲通知後，得命地面水體之管
          理人就環境影響與健康風險、技術及經濟效益等進行評估，經
          中央主管機關審核認為具整治必要性及可行性者，由地面水體
          之管理人於擬定計畫報請中央主管機關核定後，始得實施。
  二、底泥品質指標項目濃度高於下限值且低於上限值者，目的事業主管
      機關應針對該項目增加檢測頻率。