本基金之用途如下：
  一、空氣污染防制專戶
  （一）關於主管機關執行空氣污染防制工作事項。
  （二）關於補助及獎勵各類污染源辦理空氣污染改善工作事項。
  （三）關於委託或補助檢驗測定機構辦理使用中汽車排放空氣污染物檢
        驗事項。
  （四）關於委託或補助專業機構辦理固定污染源之檢測、輔導及評鑑事
        項。
  （五）關於空氣污染防制技術之研發及策略之研訂事項。
  （六）關於涉及空氣污染之國際環保工作事項。
  （七）關於空氣品質監測事項。
  （八）關於空氣污染防制執行成效之稽核事項。
  （九）關於徵收空氣污染防制費之相關費用事項。
  （十）關於補助營建工程棄土場之設置事項。
  （十一）執行空氣污染防制相關工作所需人力之聘僱事項。
  （十二）其他有關空氣污染防制工作事項。
  二、水污染防治專戶
  （一）飲用水水源水質保護區及水污染總量管制區水質改善。
  （二）公共污水下水道系統主、次幹管、污水處理廠及廢（污）水截流
        設施之建設。
  （三）水肥投入站及水肥處理廠之建設。
  （四）廢（污）水處理設施產生之污泥，集中處理設施之建設。
  （五）水污染防治技術之研究發展、引進及策略之研發。
  （六）執行收費相關之必要支出及所需人員之聘僱。
  （七）其他有關水污染防治工作。
  轄內污水下水道服務人口普及率未達百分之四十以上者，前項第二款第
  二目之分配比例不得低於百分之七十。同款第六目之支用比例不得高於
  百分之十。