一、各科室
  （一）人民陳訴檢舉機關或員工重大違失，須待查證事項。
  （二）上級交辦及其他機關送辦之機密事項。
  （三）有關機密業務之收發文事項。
  （四）依電腦處理個人資料保護法及其施行細則規定應予保密事項。（
        五）依法令規定應行保密事項。
  （六）參與本監考績委員及人事評審會議決議內容。
  （七）本監員工個人資料涉及個人尊嚴或隱私等不宜公開資料。
  （八）受刑人基本、刑期資料及辦理移監事項。

二、教化科及戒護科
  （一）受刑人假釋案。
  （二）有關受刑人保護管束、更生保護之相關資料。

三、戒護科
  （一）現有武器彈藥及各項鎮暴安全等裝備。
  （二）受刑人移監及返家探視事項。

四、衛生科
  （一）受刑人病歷資料。
  （二）辦理戒護就醫事項。

五、總務科
  （一）部次長以上長官巡視特定行程。
  （二）辦理比價、公開招標之營繕工程及採購案。

六、政風室
  （一）查處政風（含檢舉）案件。
  （二）危害或破壞機關安全事件之預防事項涉及機密部分。
  （三）重大危害或破壞機關安全事件之調查分析專報。
  （四）蒐報有關洩密資料案件。
  （五）違規或洩密案件之查處事項。
  （六）專案保密計畫（措施）尚未結案前。