本組織規程依金門縣政府組織自治條例第十三條規定訂定之。

  金門縣水產試驗所（以下簡稱本所）置所長，承縣長之命，綜理所務，
  並指揮監督所屬員工。

  本所設下列各課，分別掌理有關事項：
  一、海洋漁業課：掌理海洋資源調查、開發及漁撈技術之試驗研究與推
      廣。
  二、養殖漁業課：掌理漁業養殖、品種改良、人工繁殖及魚病防治之試
      驗研究與推廣。
  三、行政課：掌理研考、印信、文書、出納、財產、庶務、營繕工程及
      不屬其他各課之綜合業務。

  本所置課長、技正、技士、技佐、辦事員。

  本所置人事管理員，由金門縣政府派員兼任，依法辦理人事管理事項。

  本所設會計室，置會計主任，依法辦理歲計、會計，並兼辦統計事項。

  本規程所列職稱之官等職等及員額，另以編制表定之。
  各職稱之官等職等，依職務列等表之規定。

  本所為推行所務，得由所長召開所務會議，其會議規則另定之。

  本所分層責明細表由本所擬訂，報請金門縣政府核定之。

  本規程自中華民國九十三年二月二十一日施行。