科學工業園區貿易業務管理辦法（以下簡稱本辦法）自六十九年九月二十
四日訂定發布，歷經八次修正，最近一次修正發布日期為九十三年十一月
二十四日。為配合科學園區設置管理條例（以下簡稱本條例）於一百零七
年六月六日修正公布，爰修正本辦法，並將名稱修正為「科學園區貿易業
務管理辦法」，其修正要點如下：
一、配合本條例修正通過，將「科學工業園區」修正為「科學園區」。（
    修正條文第一條、第二條及第十九條）
二、依科技部所屬機關組織法及現行實際情形，並無園區管理局分局之組
    織，爰刪除有關分局之相關文字。（修正條文第二條、第四條至第八
    條、第十一條、第十三條、第十四條、第十六條至第十九條）
三、配合本條例修正通過，放寬可進駐園區之組織類型，不限以公司經營
    之事業，爰將「公司」變更登記修正為「相關」變更登記，以資周延
    。（修正條文第五條及第十三條）
四、「園區通關自動化作業系統」依現行名稱修正為「科學園區通關系統
    」，以符實際。（修正條文第六條至第九條及第二十三條）
五、管理局現行並無向園區事業收取科學園區通關系統連線費用，爰刪除
    有關應負擔電腦連線作業費用及計收標準之規定，以符實際。（修正
    條文第六條）
六、為符實務作業情形，明定園區事業之輸出入貨品依其他法令須由有關
    機關審查或發證者，應依該機關相關規定辦理。（修正條文第十一條
    及第十三條）
七、參照貨品輸出管理辦法、貨品輸入管理辦法及戰略性高科技貨品輸出
    入管理辦法等規定，對特定貨品得核發有效期限較短或較長的輸出、
    入許可證，爰增列輸出及輸入許可證有效期限，於貿易主管機關另有
    規定者，從其規定，以符合實務運作。（修正條文第十二條及第十七
    條）