本所設下列四課，分別掌理有關事項：
一、家畜防疫課：掌理豬隻及草食動物疾病防疫等事項。
二、家禽防疫課：掌理家禽疾病防疫、總務及相關行政業務等事項。
三、檢診公衛課：掌理動物疾病檢驗診斷、野生動物救護、藥政及獸醫師
    （佐）登記管理等事項。
四、動物保護課：掌理寵物救護與登記管理、動物保護、收容與認養等事
    項。

本所置技正、課長、技士、課員、技佐、辦事員及書記。
前項辦理動物防疫業務之技正、課長、技士、技佐均由具獸醫師資格者任
之。但本規程施行前已任用之現職具獸醫佐資格者，得不受前述規定之限
制。

本所得視業務需要，設置工作站、收容所，掌理有關事項：
一、工作站：掌理水產動物疾病檢診、水質檢測及動物疾病防治相關諮詢
    業務等事項。
二、收容所：掌理動物收容與認養等事項。
前項工作站、收容所人員就本所人員中調派之，必要時得委託執業獸醫師
辦理。

本所設人事室，置主任，依法掌理人事管理事項。

本所設會計室，置主任，依法掌理歲計、會計及統計事項。

本所設政風室，置主任，依法掌理政風事項。

本規程所列各職稱之官等職等及員額，另以編制表定之。
各職稱之官等職等，依職務列等表之規定。

本規程自發布日施行。