本自治條例依地方行政機關組織準則第三條第二項規定制定之。

  連江縣政府（以下簡稱本府）依法辦理自治事項，執行中央委辦事項，
  並監督鄉自治。

  本府置縣長一人，綜理縣政，指揮、監督所屬員工及機關。置副縣長一
  人，襄助縣長處理縣政。

  本府置主任秘書一人，為幕僚長，承縣長之命，處理縣政。置秘書二人
  ，受主任秘書之指揮、監督，掌理機要、動員、協調、核稿等事項。

  本府置參議三人，承縣長之命，辦理縣政設計、法案審核、協調各局室
  業務，並備諮詢有關縣政事項。

  本府設下列局、室，分掌有關事項：
  一、民政局：掌理自治行政、宗教、禮俗、調解、公共造產、社會行政
      、社會福利、戶籍行政、合作行政、勞工行政、兵役行政、就業輔
      導、勞工安全、勞資關係、土地行政、僑民服務及其他有關民政等
      事項。
  二、財政局：掌理財務行政、稅務行政、公產、公債、庫款支付、公庫
      、地方金融管理、菸酒管理、油品管理及其他有關財政等事項。
  三、教育局：掌理國民教育、社會教育、幼稚教育、特殊教育、體育及
      其他教育等事項。
  四、建設局：掌理農、林、漁、牧、農漁會輔導、農畜產品、共同運銷
      與生態保育之企劃、農產品批發市場管理、農藥管理、水土保持、
      農路管理維護、漁港管理與維護，以及工、商、礦業、零售市場、
      攤販管理、公用事業、公營事業、公平交易、度量衡業務、中小企
      業輔導、國宅業務及其他有關工商、農漁業等事項。
  五、工務局：掌理都市計畫、道路工程、土木工程、下水道工程、水利
      工程、建築管理、違章處理、戴亞路採取、災害工程、水利設施管
      理、公共設施及其他有關工務等事項。
  六、觀光局：掌理觀光事業之規劃、輔導、推動、觀光旅館、旅行業、
      導遊人員之管理、觀光從業人員之培育、訓練、觀光資源之調查、
      研究與大陸事務及其他有關觀光等事項。
  七、環境保護局：掌理空氣污染防治、噪音與振動管制、水污染、熱污
      染與土壤污染防治、水質管理與飲用水衛生管理、公害糾紛處理，
      以及廢棄物管理規劃、廢棄物處理場（廠）營運管理、環境衛生管
      理監督、環境影響評估、環境教育、環境用藥管理、毒性物質管制
      ，以及其他有關環保事項。
  八、交通局：掌理交通行政、運輸規劃、交通管理、船舶管理、交通設
      施及維護、停車場規劃管理，以及交通改善等相關事項。
  九、文化局：掌理文化、藝術、文獻、文物、古蹟維護、城鄉聚落及其
      他有關文化等事項。
  十、秘書室：掌理公共關係、印信、文書、檔案管理、庶務、出納、採
      購行政及其他不屬各局、室之業務等事項。
  十一、企劃室：掌理綜合設計規劃、研究發展、管制考核、推動為民服
        務、公文稽催與法制、訴願、國家賠償、消費者保護、資訊管理
        、新聞，以及其他有關管考等相關事項。
  前項各局、室職掌內容，除法令另有規定者外，必要時得依地方行政機
  關組織準則第八條之規定調整之。

  本府置局長、主任、消費者保護官、專員、課長、督學、視導、技正、
  課員、技士、技佐、辦事員及書記。

  本府設人事室，置主任一人，依法辦理人事管理事項；所需工作人員就
  本自治條例所定員額內派充之。

  本府設主計室，置主任一人，依法辦理歲計、會計、統計事項；所需工
  作人員就本自治條例所定員額內派充之。

  本府設政風室，置主任一人，依法辦理政風事項；所需工作人員就本自
  治條例所定員額內派充之。

  本府設警察局、消防局、衛生局、稅捐稽徵處等一級機關，分別掌理有
  關事項，其組織規程另定之。
  各局置局長、各處置處長，承縣長之命，分別掌理各該局、處事務，並
  指揮監督所屬機關及員工。各局得置副局長、副處長，襄理局、處務。

  本府下設大同之家、公路監理所、港務處、地政事務所山各鄉戶政事務
  所等二級機關，分別受各業務主管局之督導，辦理特定業務；其組織規
  程另定之。
  本府為應業務需要及辦理上級政府授權或委託業務，得增設附屬機關，
  其組織規程另定之。

  本府及所屬機關除醫院及警察、消防機關外，員額總數最高為一八七人
  。
  本府及所屬各機關之員額數，除醫院及警察、消防機關外，由縣長於前
  項員額總數內，依地方行政機關組織準則第二十一條之規定分配之。醫
  院及警察、消防機關之員額數，依中央各該主管機關訂定之設置基準定
  之。

  本自治條例所列各職稱之官等及員額，另以編制表定之。
  各職稱之職等，依職務列等表之規定。

  本府得視實際需要，設事業機構；其組織自治條例由本府擬訂，經縣議
  會通過,報請內政部備查。

  縣長請假時，由副縣長代行。副縣長因故不能代行時，由主任秘書代行
  。
  主任秘書同時因故不能代行時，依第六條所列單位主管順序代行之。
  縣長停職時，由副縣長代理，副縣長出缺或不能代理者，由內政部報請
  行政院派員代理。縣長辭職、去職、死亡者，由內政部報請行政院派代
  理。
  前項縣長辭職，應以書面向內政部提出，由內政部轉報行政院核准，自
  核准辭職日生效。

  本府設縣務會議，由下列人員組成之：
  一、縣長。
  二、副縣長。
  三、主任秘書、參議、秘書。
  四、各局、室主管。
  五、所屬一級機關首長。
  六、縣長指定人員。
  前項會議，由縣長召集之，開會時並為主席，縣長因故不以出席時，由
  職務代理人擔任主席。

  下列事項應經縣務會議之決定：
  一、施政計畫與預算。
  二、縣規章及自治規則。
  三、提請縣議會審議之案件。
  四、本府及所屬機關組織編制調整事項。
  五、涉及各一級單位或所屬機關共同關係事項。
  六、縣長交議事項。
  七、其他有關縣政重要事項。

  本府分層負責明細表，由本府定之。
  本府所屬機關分層負責明細表，由各所屬機關擬訂，報本府核定。

  本自治條例自中華民國八十九年元月一日施行。
  本自治條例修正條文自公布日施行。